Аксонема (axoneme) – структура, разположена централно по дългата ос на ресничките и камшичетата. Състои се от 9 двойки периферно разположени микротубули (вж. микротубули) и две микротубули в централната част на аксонемата (фиг. 1.).

Фиг. 1. Аксонема в реснички (електронномикроскопска снимка): (А) надлъжен и (Б) напречен пререз